Albator, capitaine du vaisseau Arcadia, est un corsaire de l`espace.
Il est condamné à mort, mais reste insaisissable.
Le jeune Yama, envoyé pour l`assassiner, s`infiltre dans l`Arcadia, alors qu`Albator décide d`entrer en guerre contre la coalition Gaia afin de défendre sa planète d`origine, la Terre.